MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070010 complete genome

Total Repeats: 11722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_019951	GCC	2	6	4209140	4209145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11002	NC_019951	TCC	2	6	4209172	4209177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11003	NC_019951	CGC	2	6	4209181	4209186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11004	NC_019951	CCG	2	6	4209300	4209305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11005	NC_019951	GGC	2	6	4209310	4209315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_019951	CG	3	6	4209330	4209335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11007	NC_019951	TGG	2	6	4209384	4209389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_019951	CGG	2	6	4209390	4209395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_019951	CGA	2	6	4209420	4209425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_019951	GCC	2	6	4209431	4209436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11011	NC_019951	CCG	2	6	4209474	4209479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11012	NC_019951	CGA	2	6	4209484	4209489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_019951	CGG	2	6	4209495	4209500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11014	NC_019951	GCGG	2	8	4209553	4209560	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11015	NC_019951	GCC	2	6	4209616	4209621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11016	NC_019951	GCC	2	6	4209625	4209630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11017	NC_019951	CGC	2	6	4209638	4209643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11018	NC_019951	GCC	2	6	4210167	4210172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11019	NC_019951	ACC	2	6	4210192	4210197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11020	NC_019951	ACC	2	6	4210234	4210239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11021	NC_019951	GCG	2	6	4210312	4210317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_019951	CGG	2	6	4210348	4210353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_019951	CAC	2	6	4210363	4210368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11024	NC_019951	CCT	2	6	4211928	4211933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11025	NC_019951	AAC	2	6	4211941	4211946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_019951	CGAC	2	8	4211956	4211963	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11027	NC_019951	CGCT	2	8	4212059	4212066	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11028	NC_019951	TCG	2	6	4212077	4212082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_019951	ACG	2	6	4212740	4212745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_019951	AT	3	6	4212949	4212954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_019951	CCG	3	9	4213549	4213557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11032	NC_019951	GGCTC	2	10	4213565	4213574	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11033	NC_019951	GCTC	2	8	4213577	4213584	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11034	NC_019951	CTCG	2	8	4213590	4213597	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11035	NC_019951	C	6	6	4215493	4215498	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11036	NC_019951	CGG	2	6	4215516	4215521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11037	NC_019951	CCA	2	6	4215522	4215527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11038	NC_019951	AG	3	6	4215584	4215589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_019951	CCA	2	6	4216687	4216692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11040	NC_019951	CACC	3	12	4216710	4216721	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11041	NC_019951	GAG	2	6	4216800	4216805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_019951	GAC	2	6	4216860	4216865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_019951	GAC	2	6	4216887	4216892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_019951	G	7	7	4216901	4216907	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_019951	AGG	2	6	4216908	4216913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_019951	GTC	2	6	4216919	4216924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11047	NC_019951	G	6	6	4216938	4216943	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_019951	ACA	2	6	4217070	4217075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11049	NC_019951	CGA	2	6	4218009	4218014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11050	NC_019951	CA	3	6	4218022	4218027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11051	NC_019951	GAG	3	9	4218035	4218043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_019951	CGA	2	6	4218067	4218072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11053	NC_019951	CA	3	6	4218080	4218085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11054	NC_019951	GAG	3	9	4218093	4218101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_019951	GCC	2	6	4218118	4218123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11056	NC_019951	GCGG	2	8	4218137	4218144	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11057	NC_019951	GCA	2	6	4218145	4218150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_019951	TAG	2	6	4218222	4218227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_019951	AGA	2	6	4218271	4218276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_019951	CAG	2	6	4218382	4218387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_019951	TGGG	2	8	4218406	4218413	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_019951	CCAC	2	8	4218448	4218455	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11063	NC_019951	TGG	2	6	4218496	4218501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_019951	GCG	2	6	4218502	4218507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_019951	TTC	2	6	4218515	4218520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11066	NC_019951	CGC	2	6	4218525	4218530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11067	NC_019951	CCG	2	6	4218574	4218579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11068	NC_019951	GCG	2	6	4218660	4218665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11069	NC_019951	CGG	2	6	4218738	4218743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_019951	CGG	2	6	4218751	4218756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_019951	CTT	2	6	4224656	4224661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_019951	AC	3	6	4224712	4224717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11073	NC_019951	CGT	2	6	4224795	4224800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_019951	CAC	2	6	4224823	4224828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11075	NC_019951	GAC	2	6	4224891	4224896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11076	NC_019951	TCG	2	6	4224931	4224936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11077	NC_019951	CG	3	6	4224935	4224940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11078	NC_019951	CGGC	2	8	4226939	4226946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11079	NC_019951	GCC	2	6	4227734	4227739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11080	NC_019951	CGC	2	6	4227767	4227772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11081	NC_019951	TGGC	2	8	4227782	4227789	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11082	NC_019951	GCACC	2	10	4227798	4227807	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11083	NC_019951	CGA	2	6	4227848	4227853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11084	NC_019951	GAG	3	9	4227874	4227882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_019951	CGA	2	6	4227906	4227911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11086	NC_019951	GAG	3	9	4227932	4227940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_019951	CGA	2	6	4227964	4227969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11088	NC_019951	GAG	3	9	4227990	4227998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_019951	CGA	2	6	4228022	4228027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11090	NC_019951	CCG	2	6	4228059	4228064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11091	NC_019951	GGCGAG	2	12	4228067	4228078	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
11092	NC_019951	CCT	2	6	4231628	4231633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11093	NC_019951	CTC	2	6	4231654	4231659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11094	NC_019951	CCG	2	6	4231687	4231692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11095	NC_019951	CCGCA	2	10	4231737	4231746	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11096	NC_019951	G	6	6	4232414	4232419	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_019951	TTG	2	6	4232420	4232425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_019951	CGG	2	6	4233178	4233183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11099	NC_019951	CG	3	6	4233184	4233189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11100	NC_019951	TCG	2	6	4233735	4233740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11101	NC_019951	GC	4	8	4234434	4234441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11102	NC_019951	CAG	2	6	4234460	4234465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11103	NC_019951	CGCA	2	8	4234475	4234482	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11104	NC_019951	ACG	2	6	4234484	4234489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11105	NC_019951	GCT	2	6	4234509	4234514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11106	NC_019951	TCGG	2	8	4235965	4235972	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11107	NC_019951	CGCTC	2	10	4235981	4235990	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11108	NC_019951	CGA	2	6	4238243	4238248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11109	NC_019951	CG	3	6	4238256	4238261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11110	NC_019951	TCC	2	6	4238778	4238783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11111	NC_019951	GCC	2	6	4238786	4238791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11112	NC_019951	CTC	2	6	4238805	4238810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11113	NC_019951	TGC	2	6	4238823	4238828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_019951	GGT	2	6	4238888	4238893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_019951	T	6	6	4238926	4238931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_019951	GCC	2	6	4238973	4238978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11117	NC_019951	CCCG	2	8	4239056	4239063	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11118	NC_019951	AGG	2	6	4239104	4239109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_019951	GTA	2	6	4239118	4239123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_019951	CG	3	6	4241591	4241596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11121	NC_019951	GCG	2	6	4242588	4242593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11122	NC_019951	GGAC	2	8	4242630	4242637	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11123	NC_019951	GC	3	6	4243774	4243779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11124	NC_019951	TTCG	2	8	4243780	4243787	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11125	NC_019951	GA	3	6	4243828	4243833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_019951	GAC	2	6	4243839	4243844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11128	NC_019951	GGC	2	6	4243888	4243893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11129	NC_019951	CGC	2	6	4244078	4244083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11160	NC_019951	TTG	2	6	4254251	4254256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11247	NC_019951	ACTG	2	8	4306995	4307002	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11248	NC_019951	CA	3	6	4307013	4307018	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11249	NC_019951	CAGC	2	8	4307090	4307097	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11250	NC_019951	GGCT	2	8	4307132	4307139	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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